农业产业化部主要职能是推动公司大棉商战略布局，积极配合推动与兵团、供销社战略合作；配合棉花事业部进行棉花产业政策研究，调研“公司+农户”关键模式，主要包括订单农业和“公司+农户”关键模式探讨与设计。